A história da Primeira Igreja Evangélica Batista em Cubatão começa na década de cinquenta com a iniciativa da Primeira Igreja Batista em Santos, sob o pastorado do saudoso Pr. Alberto Augusto, de iniciar em Cubatão um trabalho batista. Foi então que o irmão Barreto Bitencourt, membro da PIB de Santos, acolheu o novo trabalho, em sua residência, sob direção do irmão Diácono Glicério. Posteriormente, o irmão Arthur Português de Souza e membro também da PIB de Santos, disponibilizou o espaço de sua casa à Rua Paraná nº 2 para abrigar as reuniões.
Em vista do crescimento numérico e falta de espaço, o irmão Arthur vendeu o terreno de sua propriedade, anexo à sua casa para PIB de Santos construir o templo na Rua Paraná nº 4 Vila Santa Rosa – Cubatão. Destacamos três famílias que deram início aquele trabalho promissor: Familia Barreto Bitencourt, Familia Menezes de Lima e Português de Souza. O primeiro pastor da nova igreja foi o seminarista Cristovam Fagundes que teve o concílio examinador realizado já no templo recém construído. Aprovado que foi, o Pr. Cristovam foi empossado e assumiu o seu primeiro ministério.
Depois do Pr. Cristovam, a igreja teve o seu segundo pastor, Pr. Natanaél Vicente do Nascimento, que deixou o ministério da igreja para ser missionário da Junta de Missões Nacionais no campo baiano, com a sua esposa irmã Berenice. Assume o ministério o Pr. Eclésio Corrêa de Oliveira como terceiro pastor da igreja. Vários pastores deixaram suas marcas indeléveis no ministério da igreja: Pr. Rômulo Vieira Teles, que com a visão da necessidade de um novo templo, adquiriu o antigo Cinema São Francisco para a igreja. Pr. Anatole Pirilampo Moreira da Silva, Pr. Jedais Ribeiro, José Florêncio da Silva, Pr. Joaquim Lopes Leão, Pr. Elizeu Schimenes (interino), Pr. Robert Smith (interino), Jonathan Guy Key (interino), Gilson Schuler Amorim, Pr. Gary Charles Evans, Pr. Roberto Pereira da Silva, Pr. Silas Molochenco (interino) , Pr. Lutero Honório Guerra Corrêa de Oliveira, Pr. Joel Baptista de Souza, Pr. Alípio Acácio Coutinho Junior e atualmente o pr. Weslley Santos de Araújo e pr. Alyson Diego de Azevedo Araujo são os pastores da igreja.